啟東市基督教三自愛國會自2008年籌建財務托管中心以來，按照 收取兩費的10%，用于教職員工的工資發放。2008年-2012年的教職人員的工資福利基本上能控制在10%左右，隨著教職人員增加和2012 年9月之后的教職人員工資調查，目前兩費的10%不足于工資的發放， 差額部分在10%的活動經費中解決，具體情況如下：
一、三年來市三自工資運行的基本情況
2013年度總收入6281061.46元，應收兩費876368元，工資發放 416949元，占兩費的48%，也就是說用于工資福利發放的15%在活動經費33%中解決，活動經費的近一半用于工資福利的發放。
2014年度總收入6680127.11元，應收兩費1060250元，工資福利發放772965. 97元，占兩費的73%。（其中包含2012. 9-2013. 12工資調整后的補發工資和2013年度的績效工資）。兩費收入中的66%(10% 的工資、10%的活動經費）還不足于工資的發放，從教牧基金33%中的7%拿來發放工資。
2015年度總收入6109559.43元，應收兩費1205663元，工資福利發放787640. 45元，占兩費的65%，（當年新增三名教職工作人員）當年兩費中的10%活動經費基本上全部用于發放教職工作人員的工資。
二、 2013年-2015年各堂（所）教職人員工資發放占比情況：
2013年各堂（所）上繳兩費數與本場所教職人員工資發放占比情況如下：匯龍堂40%,和合堂39%，北新堂45%，近海堂44%，南陽堂19%呂四堂32%，惠萍堂22%,合作堂68%，秦潭堂62%，海復堂120%， 東海堂26%，寅陽堂27%，萬安堂60%，王鮑堂57%。（南陽、呂四' 惠萍、東海、寅陽等五個堂在33%以內，也就是說，符合兩費中的10%用于發工資的要求）
2014年度，匯龍堂44%，和合堂31%，北新堂45%,近海堂55%， 南陽堂22%，呂四堂32%，惠萍堂38%，合作堂85%，秦潭堂64%，海 復堂95%，東海堂63%，寅陽堂54%，萬安堂45%，王鮑堂66%。（和合、寅陽、呂四堂在33%以內）
2015年度，匯龍堂42%，和合堂26%，北新堂52%，近海堂59%， 南陽堂25%,呂四堂34%，惠萍堂43%，合作堂95%，秦澤堂84%,海復堂54%，東海堂20%，寅陽堂56%，萬安堂79%，王鮑堂58%。（南陽、東海在33%以內）
三、基本情況分析：
一是2012年9月教職人員工資調整后，生活待遇提高了，奉獻 款總額增幅不明顯，原來確定的兩費中的10%已滿足不了教職人員工 資發放需求。
二是教職人員實施養老保險、醫療保險制度后，單位支付額增大，年人均增加8900多元。（其中和合、南陽、呂四、秦潭、東海、寅陽、王鮑未辦理養老保險和醫療保險）
三是設立建堂基金的單位，上繳兩費的基數比留作建堂基金總額低了很多。2013年度，海復上繳兩費基數9.5萬，建堂基金63.5萬； 南陽上繳兩費基數31.1萬，建堂基金60.5萬；近海上繳兩費基數24萬，建堂基金36.1萬。2014年度海復上繳基數5. 6萬，建堂基金 54. 5萬；近海上繳兩費基數13萬，建堂基金45.1萬；匯龍上繳兩費基數51.4萬，建堂基金91,7萬；王鮑上繳兩費基數5.6萬，建堂基金9. 8萬；呂四上繳兩費基數26. 1萬，建堂基金34萬。2015年王鮑上繳兩費基數6. 6萬，建堂基金14.7萬;近海上繳兩費基數26.6 萬，建堂基金42. 4萬；匯龍上繳兩費基數63. 3萬元，建堂基金73. 9 萬元。
四是信徒隊伍不穩定，教會的影響力減弱，導致奉獻額下降。從 目前情況來看，由于外來傳道人的侵入和家庭私聚現象的增多，教會 信徒隊伍不穩定，與2012年相比，2015年信徒總人數只增加了 396 人。講臺供應不給力，信徒反映滿足不了他們的需求，教會管理松弛， 在信徒中的影響力減弱。有少數教會與信徒矛盾突出，挫傷了信徒愛教會的積極性，這些都是造成信徒隊伍不穩定，影響教會奉獻額下降的重要原因。
四、確保教職人員工資正常運行的兩點要求：
1、教職人員工資調整后確保市三自經費的正常運行，按照市民 族宗教事務局的要求，兩費標準必須達到年增幅15%，增幅提高的5% 用于工資的發放。
2、 涉及到教堂籌建、添置硬件設施的單位，要簽訂責任狀，必 須確保兩費的完成。